Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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