Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Smg8Q8VE18 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smg8Q8VE18 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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