Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Abcf3Q8K268 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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