Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lmod1Q8BVA4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmod1Q8BVA4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms