Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ChfrQ810L3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms