Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

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Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dsg1bQ7TSF1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dsg1bQ7TSF1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms