Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ckap2lQ7TS74 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms