Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Cspg5Q71M36 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Cspg5Q71M36 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cspg5Q71M36 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cspg5Q71M36 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cspg5Q71M36 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cspg5Q71M36 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cspg5Q71M36 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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