Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC174Q6PII3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms