Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms