Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pkp4Q68FH0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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