Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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PtprdQ64487 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtprdQ64487 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms