Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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