Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Pabpc2Q62029 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pabpc2Q62029 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pabpc2Q62029 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pabpc2Q62029 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pabpc2Q62029 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Pabpc2Q62029 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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