Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itga6Q61739 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms