Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf608Q56A10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf608Q56A10 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms