Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnpc3Q3UZ01 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnpc3Q3UZ01 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnpc3Q3UZ01 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms