Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms