Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mccc2Q3ULD5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms