Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms