Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cpne9Q1RLL3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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