Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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ptchd1Q14B62 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ptchd1Q14B62 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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