Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd2Q149F1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms