Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cnn2Q08093 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cnn2Q08093 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms