Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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