Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrx2Q06348 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms