Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Thbs2Q03350 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms