Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Tp53bp1P70399 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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