Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rab4aP56371 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rab4aP56371 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab4aP56371 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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