Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec1P51908 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms