Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PtpreP49446 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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