Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pax9P47242 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pax9P47242 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms