Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nedd4P46935 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms