Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gdf5P43027 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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