Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp4P35123 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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