Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PrkcaP20444 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PrkcaP20444 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms