Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P18524 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18524 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms