Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
UbbP0CG49 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms