Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprqP0C5E4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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PtprqP0C5E4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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PtprqP0C5E4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PtprqP0C5E4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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