Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa7P02830 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms