Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lamc1P02468 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lamc1P02468 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms