Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01728 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01728 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P01728 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms