Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Cops6O88545 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cops6O88545 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cops6O88545 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms