Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DffaO54786 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DffaO54786 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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DffaO54786 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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