Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Sp100O35892 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sp100O35892 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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