Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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