Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prrt1O35449 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prrt1O35449 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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