Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pitx3O35160 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms