Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms