Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PbsnO08976 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PbsnO08976 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PbsnO08976 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms